Secuenciación de Sanger en el SARS-CoV-2

Técnica de detección rápida, permite establecer el origen de variantes, vigilancia epidemiológica, diseño de vacunas y tratamientos. Su proceso: 1. Extracción del ARN: Se aísla el ARN viral del SARS-CoV-2. 2. Transcripción inversa: Conversión en ADN complementario (cADN). 3. Amplificación por PCR: Generación de múltiples copias y etiquetación con fluoróforos. 4. Secuenciación: Se usa secuenciación de Sanger, se añaden bases de nucleótidos modificados en reacciones separadas. 5. Electroforesis: Los fragmentos de ADN se separan según su tamaño en un gel. 6. Lectura: Detección de los colores emitidos por las bases para determinar la secuencia de ADN del virus.

Tabla 1. Secuenciación de Sanger de los genes Spike del SARS-Cov-2. Se muestran el nombre del cebador, la secuencia, la longitud, la temperatura de hibridación (Tm) y la ubicación en todo el fragmento del genoma del SARS-CoV-2 que abarca el marco de lectura abierto (ORF) de la glicoproteína Spike. Obtenido de: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/irv.12892

Referencia bibliográfica:

1. Daniels RS, Harvey R, Ermetal B, Xiang Z, Galiano M, Adams L, et al. A Sanger sequencing protocol for SARS‐CoV‐2 S‐gene. Influenza and Other Respiratory Viruses [Internet]. 2021 [citado 23 de diciembre de 2023];15(6). Disponible en: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/irv.12892